Очень полезный сайт на тему транскрипций произведений Баха, материалы с которого очень помогли в том числе и в составлении этого списка: http://www.bach-cantatas.com/NVD/PT.htm
Если у Вас есть дополнительная информация о транскрипциях, пожалуйста, напишите мне, и я с удовольствием добавлю их в этот список! 
 

Владимир Сергеевич Белов (1906-1989)
·      Аллеманда из Партиты для флейты соло, ля минор, BWV 1013, НОТЫ: Научная Библиотека СПБГК 
·      Сицилиана из Сонаты для флейты № 2, BWV 1031, НОТЫ: Научная Библиотека СПБГК

Борис Борисович Бородин (р. 1951)
·      Crucifixus и Et incarnates из Мессы си минор BWV 232

Исайя Александрович Браудо (1896-1970)
·      Речитатив из Концерта № 3 в до мажоре (по А. Вивальди), BWV 594. 
·      Хоральная прелюдия horale Alle Menschen müssen sterben (I), BWV 643 

Станислав Станиславович Бунин (р. 1966)
·      Arioso из Концерта № 5, фа минор, BWV 1056

Анатолий Иванович Ведерников (1920-1993)
·      Хоральная прелюдия Puer natus in Bethlehem, BWV 603  
·      Хоральная прелюдия In dulci jubilo, BWV 608  
·      Хоральная прелюдия Wenn wir in höchsten Nöten sein, BWV 641  
·      Хоральная прелюдия Alle Menschen müssen sterben (I), BWV 643  
·      Хоральная прелюдия Wachet auf, ruft uns die Stimme, BWV 645  
·      Хоральная прелюдия Nun komm' der Heiden Heiland (II), BWV 659  
·      Хоральная прелюдия Nun freut euch, lieben Christen, BWV 734  
·      Бранденбургский концерт № 3 соль мажор, BWV 1048, НОТЫ: Научная Библиотека СПБГК  
·      Бранденбургский концерт № 5 ре мажор, BWV 1050, НОТЫ: Научная Библиотека СПБГК
·      Бранденбургский концерт № 6 си бемоль мажор BWV 1051, НОТЫ: Научная Библиотека СПБГК

Николай Выгодский (1900-1939)
·      Kyrie № 1 из Мессы си минор BWV 232  
·      Оркестровая сюита № 2 си минор, BWV 1067  НОТЫ: Российская Государственная Библиотека
·      Ария из Оркестровой сюиты № 3 ре мажор, BWV 1068, НОТЫ: ЦГПБ им. Маяковского

Александр Фёдорович Гедике (1877-1957)
·      Ария для сопрано Schafe können sicher weiden из Кантаты BWV 208
·      Прелюдия и фуга ре минор, BWV 539 НОТЫ: Ярославская Научная БиблиотекаЦГПБ им. Маяковского
·      Прелюдия и фуга соль мажор, BWV 541  
·      Прелюдия и фуга соль мажор, BWV 550  
·      Фуга до минор на тему Легренци, BWV 574  
·      Фуга до минор, BWV 575
·      Пассакалия до минор, BWV 582, в переложении для 4х рук
Хоральные прелюдии: НОТЫ: Ярославская Научная Библиотека (шесть прелюдий), ЦГПБ им. Маяковского (органная прелюдия ми-бемоль мажор)
·      Хоральная прелюдия Das alte Jahr vergangen ist (I), BWV 614   
·      Хоральная прелюдия O Mensch, bewein' dein’ Sünde gross, BWV 622  
·      Хоральная прелюдия Wir danken dir, Herr Jesu Christ, BWV 623
·      Хоральная прелюдия Jesus Christus, unser Heiland (I), BWV 626   
·      Хоральная прелюдия Alle Menschen müssen sterben (I), BWV 643
·      Хоральная прелюдия Meine Seele erhebet den Herren, BWV 648   
·      Хоральная прелюдия Herzlich tut mich verlangen, BWV 727   
·      Концерт для клавесина, струнных и континую № 7 соль минор, BWV 1058, в переложении для двух роялей

В. Гончаренко (?)
·      Хоральная прелюдия фа минор, в переложении для двух роялей, НОТЫ: онлайн здесь.

Александр Михайлович Гончаров (1929-2011)
·      Избранные хоральные прелюдии, НОТЫ: ЦГПБ им. Маяковского
·      Трио ре минор BWV неизвестен, НОТЫ: ЦГПБ им. Маяковского
·      Largo из органной сонаты д BWV 529, НОТЫ: ЦГПБ им. Маяковского

Сергей Диденко (1944-?)
·      Хоральная прелюдия Herr Christ, der einig Gottes Sohn (I) BWV 601
·      Хоральная прелюдия Christ, unser Herr, zum Jordan kam (I) BWV 684 
·      Хоральная прелюдия Herzlich tut mich verlangen BWV 727
·      Хоральная прелюдия Lobt Gott, ihr Christen, allzugleich (II) BWV 732
·      Клавирный концерт ре минор, переложение для двух роялей, НОТЫ: ЦГПБ им. Маяковского
·      Клавирный концерт фа минор, переложение для двух роялей, НОТЫ: Российская Государственная Библиотека, ЦГПБ им. Маяковского

Анатолий Николаевич Дроздов (1883-1950)
·      Прелюдия соль минор BWV 535, НОТЫ: Научная Библиотека СПБГК
·      Хоральная прелюдия Aus der Tiefe rufe ich, BWV 745
·      Хоральная прелюдия Jesu Leiden, Pein und Tod, BWV Anh 57

Игорь Жуков (1936-?)
·      Пассакалия и фуга до минор, BWV 582
·      Токката и фуга ре минор BWV 565, Бах-Таузиг-Жуков (Подтверждения не найдено) 

Сергей Жуков (?)
·      Пассакалия до минор, BWV 582

Александр Ильич Зилоти (1863-1945)
·      Sinfonia из Кантаты BWV 29
·      Sinfonia из Кантаты BWV 35
·      Духовная песня Komm süsser Tod, BWV 478
·      Прелюдия соль минор, BWV 535
·      Прелюдия ми минор, BWV 555
·      Токката и фуга ре минор, BWV 565
·      Пассакалия до минор, BWV 582
·      Жига из Партиты № 1 си бемоль мажор, BWV 825
·      Прелюдия си минор, BWV 855a (транскрипция прелюдии ми минор, WFN 18)
·      Парафраза на Прелюдию № 3 до диез мажор из ХТК 2, BWV 872 
·      Итальянаский концерт фа мажор, BWV 971, в переложении для двух роялей
·      Andante из Итальянского концерта фа мажор, BWV 971, в переложении для четырёх рук
·      Andante из Сонаты для скрипки соло № 2 ля минор, BWV 1003
·      Чакона из Партиты для скрипки соло № 2 ре минор, BWV 1004 (по транскрипции Ф. Бузони и изданию Общества Баха)
·      Прелюдия и Куранта из Сюиты для виолочели соло № 1 соль мажор, BWV 1007
·      Прелюдия, Бурре и Жига из Сюиты для виолончели соло № 3 до мажор, BWV 1009
·   Прелюдия из Сюиты для виолончели соло № 4 ми бемоль мажор, BWV 1010
·   Adagio из Сонаты для скрипки № 5 фа минор, BWV 1018
·   Сицилиана из Сонаты для флейты № 2, BWV 1031
·   Andante из Бранденбургского концерта № 2 фа мажор, BWV 1047, в переложении для двух роялей
·   Andante из Концерта для двух клавесинов, струнных и континуо № 3 до минор, BWV 1062, в переложении для двух роялей
·   Ария из Оркестровой сюиты № 3 ре мажор, BWV 1068
·      BWV 903 (? Подтверждения не найдено)
·      Две прелюдии, Largo и Хорал, BWV?
·      Фантазия до минор, BWV ?

Игорь Павлович Ильин (1909-1959)
·      Органная Соната до минор, BWV 526 НОТЫ: Ярославская Научная Библиотека
·      Органная Прелюдия и фуга до мажор НОТЫ: Ярославская Научная Библиотека
·      Pedal-Exercitium, BWV 598 НОТЫ: Ярославская Научная Библиотека
Хоральные Прелюдии: НОТЫ: Ярославская Научная Библиотека
·      Хоральная прелюдия Nun komm der Heiden Heiland (I), BWV 599 
·      Хоральная прелюдия Herr Christ, der einig Gottes Sohn (I), BWV 601 
·      Хоральная прелюдия Jesu, meine Freude (I), BWV 610 
·      Хоральная прелюдия Helft mir Gottes Güte preisen (I), BWV 613 
·      Хоральная прелюдия Christ lag in Todesbanden (I), BWV 625
·     Хоральная прелюдия Christ ist erstanden (I), BWV 627 
·      Хоральная прелюдия Heut triumphieret Gottes Sohn (I), BWV 630 
·      Хоральная прелюдия Vater unser im Himmelreich (I), BWV 636 
·      Хоральная прелюдия Ich dich hab ich gehoffetHerr, BWV 640 
·      Хоральная прелюдия Ach wie nichtig, ach wie flüchtig, BWV 644
·      Хоральная прелюдия Wo soll ich fliehen hin (I), BWV 646 
·      Хоральная прелюдия Nun komm der Heiden Heiland (IV), BWV 661 
·      Хоральная прелюдия Kyrie, Gott heiliger Geist (II), BWV 674 
·      Хоральная прелюдия Wir glauben all an einen Gott, BWV 681
·      Хоральная прелюдия Vater unser im Himmelreich (III), BWV 683 
·      Хоральная прелюдия Wer nur den lieben Gott lässt walten (III), BWV 690 
·      Хоральная прелюдия Ach Gott und Herr, BWV 693 
·      Хоральная прелюдия Christum wir sollen loben schon, BWV 696 
·      Хоральная прелюдия Ach Gott und Herr, BWV 714 
·      Хоральная прелюдия Allein Gott in der Höh sei Ehr (VIII), BWV 715 
·      Хоральная прелюдия Ein feste Burg ist unser Gott, BWV 720 
·      Хоральная прелюдия Herzlich tut mich verlangen, BWV 727 
·      Хоральная прелюдия Aus der Tiefe rufe ich, BWV 745

Александр Львович Иохелес (1912-1978)
·      Речитатив из Кантаты No 51, BWV 51
·      Хоральная прелюдия BWV 622
·      Ария Esurientes implevit bonis из Magnificat BWV 243

Дмитрий Борисович Кабалевский (1904-1987)
·      Органная соната № 2 до минор, BWV 526 НОТЫ: Нотно-музыкальная Библиотека имени Юргенсона
·      Токката и фуга ре минор BWV 538, НОТЫ: Научная Библиотека СПБГКЦГПБ им. Маяковского  
·      Прелюдия и фуга до минор BWV 549  
·      Токката и фуга ре минор, BWV 565  
     Восемь маленьких прелюдий и фуг: НОТЫ: Ярославская Научная Библиотека
·      Прелюдия и фуга до мажор, BWV 553
·      Прелюдия и фуга ре минор, BWV 554
·      Прелюдия и фуга ми минор, BWV 555
·      Прелюдия и фуга фа мажор, BWV 556
·      Прелюдия и фуга соль мажор, BWV 557
·      Прелюдия и фуга соль минор, BWV 558
·      Прелюдия и фуга ля минор, BWV 559
·      Прелюдия и фуга си бемоль мажор, BWV 560

Георгий Львович Катуар (1861-1926)
·      Пассакалия до минор, BWV 582 НОТЫ: Российская Государственная Библиотека

Николай Копчевский (?)
·      Искусство фуги BWV 1080 

А. Корольков (?)
·      Фуга соль минор, BWV 578 НОТЫ: Российская Государственная Библиотека

Николай Медников (1890-1942)
·      Ария для сопрано Mein glaubiges Herze from Cantata BWV 68, в переложении для двух роялей 
·      Фуга соль минор BWV 578, в переложении для двух роялей

Виктор Карпович Мержанов (1919-2012)
Избранные хоральные прелюдии: НОТЫ: Научная Библиотека СПБГК
·      Хоральная прелюдия Wer nur den lieben Gott lässt walten (I), BWV 642  
·       Хоральная прелюдия Wer nur den lieben Gott lässt walten (III), BWV 690  
·       Хоральная прелюдия Wer nur den lieben Gott laebt walten, BWV 691  
·       Хоральная прелюдия Liebster Jesu, wir sind hier (V), BWV 731  

Александр Сергеевич Немеровский (1859-?)
·      Токката ре минор, BWV 565 НОТЫ: Нотно-музыкальная Библиотека имени Юргенсона
·      Токката ре минор, BWV 565, в переложении для двух роялей 
·      Allegro из Концерта № 2 ля минор (по Вивальди), BWV 593  
·      Sicilienne из Сонаты для флейты № 2, BWV 1031 НОТЫ: Нотно-музыкальная Библиотека имени Юргенсона, и онлайн вот здесь.

 Татьяна Петровна Николаева (1924-1993)
·      Прелюдия и фуга соль минор, BWV 535 НОТЫ: Нотно-музыкальная Библиотека имени Юргенсона
·      Токката и фуга ре минор, BWV 565 НОТЫ: Нотно-музыкальная Библиотека имени Юргенсона

 Игорь Владимирович Оловников (Беларусь. Наши дни)
·      Bourree, Rondo, Minuet, Polonaise, Badinerie из Оркестровой сюиты си минор BWV 1067

 Павел Августович Пабст (1854-1897)  
·      Токката и фуга ре минор, BWV 565  
·      Токката и фугв соль минор, BWV 542 (Бах-Лист-Пабст) НОТЫ: Российская Государственная Библиотека

Алексей Парусинов (подтверждение не найдено)
·      Vivace и Allegro из Трио сонаты №6 соль мажор, BWV 530, в переложении для двух роялей 
·      Pastorale фа мажор, BWV 590, в переложении для двух роялей
·      Хоральная прелюдия Herr Christ, der einig Gottes Sohn (I), BWV 601 
·      Хоральная прелюдия Christum wir sollen loben schon, BWV 611
·      Хоральная прелюдия Dies sind die heilgen zehn Gebot (I), BWV 635
·      Хоральная прелюдия Meine Seele erhebet den Herren, BWV 648
·      Хоральная прелюдия Christ lag in Todesbanden (II), BWV 718

Сергей Васильевич Рахманинов (1873-1943)
·      Прелюдия, Гавот, и Жига из Партиты для скрипки соло № 3 ми мажор, BWV 1006

 Лев Николаевич Ревуцкий (Левко Ревуцкий) (1889-1977)
·      Фантазия до минор, BWV 562, НОТЫ: Научная Библиотека СПБГК, и онлайн здесь.
·      Фуга ре минор, BWV 539, НОТЫ: Онлайн здесь.

Аверлиан Григорьевич Руббах (?)
·      Ария из Оркестровой сюиты № 3 ре мажор, BWV 1068. НОТЫ: Российская Государственная Библиотека

Антон Григорьевич Рубинштейн (1829-1894)
·      Токката до мажор, BWV 564         
·      Фуга до минор, BWV 575

Константин Степанович Сорокин (1909-?)
·      Бранденбургский концерт № 2 фа мажор BWV 1047, НОТЫ: Научная Библиотека СПБГК

Юрий Николаевич Тюлин (1893-1978)
·      Бранденбургский концерт № 1 фа мажор, BWV 1046, НОТЫ: Научная Библиотека СПБГКЦГПБ им. Маяковского (только Адажио)
·      Бранденбургский концерт № 2 фа мажор, BWV 1047, по крайней мере Анданте, НОТЫ: ЦГПБ им. Маяковского

Самуил Евгеньевич Фейнберг (1890-1962)
·      Largo из Трио Сонаты № 5 (до мажор), BWV 529  
·      Прелюдия и фуга ми мажор BWV 533
·      Прелюдия и фуга ми минор BWV 548 НОТЫ: Ярославская Научная Библиотека и онлайн здесь
·      Концерт для органа ля минор (по А. Вивальди), BWV 593  
·   Хоральная прелюдия Alle Menschen müssen sterben (I), BWV 643
·      Хоральная прелюдия Wer nur den lieben Gott lässt walten (II), BWV 647  
·      Хоральная прелюдия Ach bleib' bei uns, Herr Jesu Christ, BWV 649  
·      Хоральная прелюдия Kommst du nun, Jesu, vom Himmel herunter, BWV 650
·      Хоральная прелюдия An Wasserflüssen Babylon (I), BWV 653  
·      Хоральная прелюдия Herr Jesu Christ, dich zu uns wend (I), BWV 655  
·   Хоральная прелюдияVon Gott will ich nicht lassen, BWV 658  
·   Хоральная прелюдия Nun komm der Heiden Heiland (II), BWV 659  
·   Хоральная прелюдия Allein Gott in der Höh sei Ehr (I), BWV 662 (версия 1)
·   Хоральная прелюдия Allein Gott in der Höh sei Ehr (I), BWV 662 (версия 2)
·   Хоральная прелюдия Allein Gott in der Höh sei Ehr (III), BWV 663  
·   Хоральная прелюдия Jesus Christus, unser Heiland (II), BWV 665  
·   Хоральная прелюдия Durch Adams Fall ist ganz verdebt, BWV 705, в переложении для четырёх рук 
·   Хоральная прелюдия Allein Gott in der Höh sei Ehr (VII), BWV 711  
·   Хоральная прелюдия Ein feste Burg ist unser Gott, BWV 720  
·   Хоральная прелюдия Valet will ich dir geben, BWV 735  
·   Хоральная прелюдия Ach Herr, mich armen Sünder, BWV 742

Иван Карлович Черлицкий (1799-1865)
·      Сборник органных пьес, НОТЫ: ЦГПБ им. Маяковского
·      Две Хоральные прелюдии, НОТЫ: Нотно-музыкальная Библиотека имени Юргенсона и онлайн вот здесь.
·      Хорал из мотета Ich lasse dich nicht, Du segnest mich denn BWV Anh 159
·      Хорал (часть 1) мотета Jesu, meine Freude BWV 227
·      Прелюдия и фуга до мажор BWV 531
·      Прелюдия и фуга ре мажор BWV 532 
·      Прелюдия и фуга ми минор BWV 533 
·      Прелюдия и фуга фа минор BWV 534
·      Прелюдия и фуга соль минор BWV 535
·      Прелюдия и фуга ля мажор BWV 536
·      Прелюдия и фуга до минор BWV 537
·      Токката ре минор BWV 538
·      Прелюдия и фуга ре минор BWV 539
·      Токката фа мажор BWV 540
·      Прелюдия и фуга соль мажор BWV 541
·      Фантазия и фуга соль минор BWV 542
·      Фуга ля минор BWV 543
·      Прелюдия и фуга си минор BWV 544
·      Прелюдия и фуга до мажор BWV 545
·      Прелюдия и фуга до минор BWV 546
·      Прелюдия и фуга до мажор BWV 547
·      Прелюдия и фуга ми минор BWV 548
·      Прелюдия и фуга ля минор BWV 551
·      Прелюдия и фуга ми бемоль мажор BWV 552
·      Прелюдия и фуга до минор BWV 562
·      Прелюдия и фуга до мажор BWV 564
·      Токката ре минор  BWV 565
·      Прелюдия ля минор BWV 569
·      Pièce d'orgue (Фантазия) соль мажор BWV 572
·      Фуга на тему Легренци до минор BWV 574
·      Фуга соль минор BWV 578
·      Фуга си минор на тему Корелли BWV 579
·      Пассакалия до минор BWV 582
·      Canzona ре минор BWV 588
·      Хоральная прелюдия Herr Christ, der einig Gottes Sohn (I) BWV 601
·      Хоральная прелюдия Das alte Jahr vergangen ist (I) BWV 614
·      Хоральная прелюдия Liebster Jesu, wir sind hier (II) BWV 634
·      Хоральная прелюдия Wachet auf, ruft uns die Stimme BWV 645 
·      Хоральная прелюдия Wo soll ich fliehen hin (I) BWV 646
·      Хоральная прелюдия Wer nur den lieben Gott lässt walten (II) BWV 647
·      Хоральная прелюдия Meine Seele erhebet den Herren BWV 648
·      Хоральная прелюдия Kommst du nun, Jesu, vom Himmel herunter 
·      Хоральная прелюдия Allein Gott in der Höh sei Her BWV 664a
·      Хоральная прелюдия Kyrie, Gott Vater in Ewigkeit (I) BWV 669
·      Хоральная прелюдия Christe, aller Welt Trost (I) BWV 670
·      Хоральная прелюдия Kyrie, Gott heiliger Geist (I) BWV 671 
·      Хоральная прелюдия Kyrie, Gott Vater in Ewigkeit (II) BWV 672
·      Хоральная прелюдия Christe, aller Welt Trost (II) BWV 673 
·      Хоральная прелюдия Kyrie, Gott heiliger Geist (II) BWV 674 
·      Хоральная прелюдия Allein Gott in der Höh sei Ehr (V), BWV 675 
·      Хоральная прелюдия Allein Gott in der Höh sei Ehr (VI), BWV 676 
·      Хоральная прелюдия Allein Gott in der Höh sei her BWV 677 
·      Хоральная прелюдия Dies sind die heilgen zehn Gebot (II), BWV 678 
·      Хоральная прелюдия Dies sind die heilgen zehn Gebot BWV 679 
·      Хоральная прелюдия Wir glauben all an einen Gott (I) BWV 680 
·      Хоральная прелюдия Wir glauben all an einen Gott BWV 681 
·      Хоральная прелюдия Vater unser im Himmelreich (II) BWV 682 
·      Хоральная прелюдия Vater unser im Himmelreich (III) BWV 683 
·      Хоральная прелюдия Christ, unser Herr, zum Jordan kam (I) BWV 684 
·      Хоральная прелюдия Aus tiefer Not schrei ich zu dir (I) BWV 686 
·      Хоральная прелюдия Aus tiefer Not schrei ich zu dir (II) BWV 687 
·      Хоральная прелюдия Jesus Christus, unser Heiland (VI) BWV 688 
·      Хоральная прелюдия Jesus Christus unser Heiland BWV 689 
·      Хоральная прелюдия Wer nur den lieben Gott laebt walten (IV) BWV 691
·      Хоральная прелюдия Ach Gott und Herr BWV 692 
·      Хоральная прелюдия Gelobet seist du, Jesu Christ (II) BWV 697 
·      Хоральная прелюдия Christ, der einig Gottes Sohn BWV 698 
·      Хоральная прелюдия Nun komm der Heiden Heiland (VI) BWV 699
·      Хоральная прелюдия Vom Himmel hoch, da komm ich her (III), BWV 701 
·      Хоральная прелюдия Lob sei dem allmächtigen Gott (II) BWV 704 
·      Хоральная прелюдия Durch Adams Fall ist ganz verdebt BWV 705 
·      Хоральная прелюдия Liebster Jesu, wir sind hier (III) BWV 706 
·      Хоральная прелюдия Ich hab mein Sach Gott heimgestellt (II) BWV 708 
·      Хоральная прелюдия Wir Christenleut BWV 710 
·      Хоральная прелюдия Allein Gott in der Höh sei Ehr (VII) BWV 711 
·      Хоральная прелюдия Gott der Vater BWV 748 
·      Хоральная прелюдия Schmücke dich, o liebe Seele BWV 759 
·      Канонические вариации на Vom himmel hoch, da komm ich her (II) BWV 769 
·      Токката ми мажор, BWV 566 (Название и BWV номер не сходятся) 
·      Хоральная прелюдия Kyrie Gott BWV 673 (Название и BWV номер не сходятся)
·      Хоральная прелюдия Gelobet seist du, Jesu Christ BWV 692 (Название и BWV номер не сходятся)
·      Хоральная прелюдия Gelobet seist du, Jesu Christ BWV 693 (Название и BWV номер не сходятся)